Ulusal Inovasyon Girisimi'nin Ikinci Çalistayi 29 Nisan 2006 günü Sabanci Üniversitesi'nde gerçeklestirildi. Ögleden önceki bölümde, Çalisma Gruplarinin 1 Ekim 2005'ten bu yana sürdürdükleri çalismalarin ardindan bulgu ve degerlendirmelerine iliskin sunuslari yapildi. Ögleden sonra ise, her bir gruptan en az bir temsilcinin katilacagi biçimde olusturulan 4 adet "tartisma grubu", tüm çalismalar hakkinda görüslerini aktardilar. Günün son bölümünde yine bir araya gelinerek, tartisma gruplarinin sözcüleri grup çalismalarindaki degerlendirmelerini paylastilar.
Bundan sonraki asamada Çalisma Gruplari tarafindan hazirlanan taslak raporlarin son haline kavusmasi için koordinasyon çalismalari devam edecektir. Ulusal Inovasyon Girisimi çalismalarini Eylül 2006 sonunda yayinlanacak olan bir raporla kamuoyuna duyuracaktir.